Das Gymnasium Harkskeide wurde in das Projekt »SHiB - Schleswig-Holstein inklusive Begabtenförderung« aufgenommen. SHiB-Schulen sind Schulen in Schleswig-Holstein, die über eine vertiefte Expertise in der Begabten- und Begabungsförderung verfügen. Das Prädikat SHiB-Schule wird Schulen verliehen, die Schülerinnen und Schüler mit ihren Stärken im Unterricht erkennen, Kinder und Jugendliche ermutigen, ihre Begabungspotenziale zu entfalten und dabei unterstützen, mögliche (Lern-) Schwierigkeiten zu überwinden.
Am Gymnasium Harksheide erfolgt die Förderung besonders begabter Schülerinnen und Schüler zum einen im Unterricht über Differenzierung, Compacting, Drehtürmodell, Tandembildung und (Teil-)Springen, zum anderen durch das Angebot von Vorträgen und Exkursionen zu unterschiedlichen Themen. Außerdem werden die Schülerinnen und Schüler bei der Teilnahme am Enrichmentprogramm des Landes Schleswig-Holstein, diversen Förderprogrammen und Wettbewerben unterstützt.